Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC2Q9Y235 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms