Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK1Q9UPV9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms