Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MED23Q9ULK4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MED23Q9ULK4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms