Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms