Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RCAN3Q9UKA8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCAN3Q9UKA8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms