Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPN3Q9UHW5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms