Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFD9

RIMBP3, RIMS-binding protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3Q9UFD9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
RIMBP3Q9UFD9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RIMBP3Q9UFD9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RIMBP3Q9UFD9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
RIMBP3Q9UFD9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RIMBP3Q9UFD9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RIMBP3Q9UFD9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RIMBP3Q9UFD9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RIMBP3Q9UFD9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RIMBP3Q9UFD9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RIMBP3Q9UFD9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RIMBP3Q9UFD9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RIMBP3Q9UFD9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC33.39■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RIMBP3Q9UFD9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RIMBP3Q9UFD9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms