Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MGAT4CQ9UBM8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGAT4CQ9UBM8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms