Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms