Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL9Q9P2J3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms