Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDH10Q9P2E7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms