Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms