Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHRF1Q9P1Y6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHRF1Q9P1Y6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms