Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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SH3BP4Q9P0V3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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SH3BP4Q9P0V3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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SH3BP4Q9P0V3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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SH3BP4Q9P0V3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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SH3BP4Q9P0V3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4Q9P0V3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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