Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP1Q9NZI2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms