Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLGN3Q9NZ94 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLGN3Q9NZ94 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLGN3Q9NZ94 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLGN3Q9NZ94 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLGN3Q9NZ94 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLGN3Q9NZ94 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLGN3Q9NZ94 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLGN3Q9NZ94 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms