Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms