Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARHL2Q9NY43 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms