Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL28Q9NXS3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms