Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOR4AQ9NXH8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms