Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms