Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms