Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms