Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms