Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUOX1Q9NRD9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms