Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LHX9Q9NQ69 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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LHX9Q9NQ69 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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LHX9Q9NQ69 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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