Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms