Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMX1Q9NP08 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX1Q9NP08 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms