Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIAA1549Q9HCM3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KIAA1549Q9HCM3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms