Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms