Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB90

RRAGC, Ras-related GTP-binding protein C, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGCQ9HB90 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRAGCQ9HB90 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRAGCQ9HB90 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGCQ9HB90 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGCQ9HB90 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGCQ9HB90 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGCQ9HB90 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGCQ9HB90 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGCQ9HB90 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGCQ9HB90 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGCQ9HB90 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGCQ9HB90 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGCQ9HB90 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGCQ9HB90 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGCQ9HB90 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRAGCQ9HB90 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRAGCQ9HB90 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRAGCQ9HB90 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms