Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF3Q9H4D5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms