Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms