Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMX4Q9H1E5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX4Q9H1E5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms