Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1D9

POLR3F, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3FQ9H1D9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3FQ9H1D9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3FQ9H1D9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3FQ9H1D9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3FQ9H1D9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3FQ9H1D9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms