Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SHARPINQ9H0F6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms