Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC22A4Q9H015 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms