Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE41Q9C0J9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms