Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J8

WDR33, pre-mRNA 3' end processing protein WDR33, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR33Q9C0J8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR33Q9C0J8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR33Q9C0J8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR33Q9C0J8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR33Q9C0J8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR33Q9C0J8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR33Q9C0J8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR33Q9C0J8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR33Q9C0J8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR33Q9C0J8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR33Q9C0J8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR33Q9C0J8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR33Q9C0J8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR33Q9C0J8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR33Q9C0J8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR33Q9C0J8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR33Q9C0J8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR33Q9C0J8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms