Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCSER1Q9C0I3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCSER1Q9C0I3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCSER1Q9C0I3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCSER1Q9C0I3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCSER1Q9C0I3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCSER1Q9C0I3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCSER1Q9C0I3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCSER1Q9C0I3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCSER1Q9C0I3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCSER1Q9C0I3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCSER1Q9C0I3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCSER1Q9C0I3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCSER1Q9C0I3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCSER1Q9C0I3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCSER1Q9C0I3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCSER1Q9C0I3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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