Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM6Q9C030 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms