Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BARHL1Q9BZE3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms