Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHANK3Q9BYB0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms