Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA5Q9BWX5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA5Q9BWX5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms