Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAGR1Q9BTK6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAGR1Q9BTK6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms