Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC77Q9BR77 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC77Q9BR77 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms