Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RHOXF2Q9BQY4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOXF2Q9BQY4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms