Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms