Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATF6BQ99941 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms