Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5SQ99766 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms